Kandidatuppsats i Statistik F4 Linda Wänström

Betyg Individuella betyg Börja skriva en logg-bok: en dagbok där det står vad varje person har gjort varje vecka Lämna in logg-boken inför sista seminariet (presentationsseminariet) För att få godkänt på kursen krävs, för terminen när uppsatsen skrivs: Presentation och närvaro vid uppsatsförslagsseminarium Presentation och närvaro vid mitterminsseminarium godkänd uppsats godkänd opposition godkänd slutpresentation samt närvaro vid minst 80% av kurskamraternas presentationer Betygskriterier – se kurshemsidan

Exempel på uppsats från tidigare år (uppsatsen finns på kurshemsdan) Expressionsanalys av Primära Tumörer och Metastaser i Bröstcancer   Emelie Wahlström & Susanne Weijmar

Generellt intryck av uppsatsen?

Sammanfattning (engelska sammanfattningen är lite kortare eftersom den ska få plats i bilioteksbladet) Bakgrund: Information om bröstcancer och mikroRNA samt motivering till varför ämnet är viktigt Syfte: Syftet med uppsatsen Metod: Vilka metoder som används samt varför Resultat: Signifikanta resultat utifrån olika statistiska metoder Slutsats: Resultaten i ord samt vad resultaten innebär

Förord – tack till organisationen samt en del personer Innehållsförteckning Figurförteckning Tabellförteckning Bilageförteckning Begreppslista

1.Inledning Information om cancer och bröstcancer och mikroRNA Information om vad författarna har gjort i uppsatsen samt motivering till varför det är viktigt Information om vilka metoder som har använts Referenser 1.1 Uppdragsgivare Kort beskrivning av Hälsouniversitetet 1.2 Syfte Syfte i ord samt tre specifika frågeställningar i punkter 1.3 Bakgrund Vikten av att studera detta. Vad uppsatsen tillför. Information om cancer, mikroRNA, qPCR och ct-värde 1.4 Etiska och samhälleliga aspekter Kort om forskningsetik Värden går inte att spåra till individer 1.5 Tidigare liknande rapporter Vad tidigare forskning har gjort/hittat

2. Datamaterial Beskrivning av rådatamaterialet Transformationer och rensning Figurer som visar fördelning för vissa variabler Förklaring till varför vissa individer plockas bort Figur som visar många nollor – motivering till metod

3. Metod och utförande 3.1 Transformering och reducering av miRNA Tranformering av värden 3.2 Normalisering Motivering till användande samt beskrivning av hur metoden används Referenser Ett exempel med figur Figur med ursprungsvärden samt normaliserade värden 3.3 Justering för multipla tester Motivering, beskrivning, referenser… 3.4 Mixturemodeller Motivering, beskrivning av metod och utförande, formler, hypoteser, exempel på beräkningar, referenser… Programvaror Kort beskrivning av programpaket som används med referenser

4. Resultat och analys 4.1 Empirical Bayes 4.2 Lachenbruch’s modell Ytterligare rensning, tabeller, figurer, kort beskrivning av resultat (vad som är signifikant, ej signifikant) 4.2 Lachenbruch’s modell Ytterligare rensning, tabeller, kort beskrivning av resultat, hypoteser

5. Diskussion 5.1 Metoddiskussion 5.2 Resultatdiskussion Fördelar/nackdelar med använda metoder Andra möjliga metoder Motivering till varför de använda metoderna passade bäst Referenser 5.2 Resultatdiskussion Resultat från de olika metoderna 5.3 Restriktioner Begränsningar i analyserna 5.4 Felkällor Beskrivning av vilka felkällor som kan förekomma samt vad som gjorts för att minimera felkällor

6. Slutsats 7. Referenser 8. Bilagor Frågeställningarna besvaras Tabeller, test…