Elektroforetisk analys av isozymvariation Växt material Specifik infärgning 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Stärkelsegelelektrofores (SGE) – Polyakrylamidegelelektrofores.

Slides:



Advertisements
Liknande presentationer
Fritidshem Elever 2013 Fritidshem - Elever 2013 Enhet:
Advertisements

•Varför? •När? Resan •Vad ska vi göra? •Vart bor vi? •Nöjen? 13:45- 14:55 Stockholm- Köpenhamn 15:40- 18:10 Köpenhamn- Chicago 20:05- 23:05 Chicago-
Här ser ni några sidor som hjälper er att lösa uppgifterna:
Restauranger och service Våren 2005 T SHR: Leif Holmström Temo: Arne Modig, David Ahlin Datum:
Innehåll, huvudpresentation 4. Rangordning av ordningsstörningar (fråga 1) 5. Problem med nedskräpning (fråga 1a) 6. Problem med skadegörelse (fråga 1b)
1 Tillämpning av Koden Innehåll •Undersökningens metod och uppläggning, inkl. bolagsurval •Sammanfattning •Genomgång av svar på fokusfrågor.
PROJEKT TRAPPSTEGET Bilaga 1 PROJEKT TRAPPSTEGET
BENÄMNA lätta ord SPRÅKTRÄNING VID AFASIKg VIII
- Hur vet vi om vi har lyckats?
Hela Sverige ska leva Totalrapport. Regeringens bidrag har medverkat till kunskapsförmedling?
Projektföljeforskning
Stora + Störst tal först. Stora additionstabellen Tanketips!
Redovisning av drogvaneundersökning åk 7-9 Strömsunds kommun 2010
Eddie Arnold - Make The World Go Away Images colorées de par le monde Déroulement automatique ou manuel à votre choix 1 för dig.
1 Hårddiskar och Disketter Boot sektorn på en diskett eller startsektorn på en partition (se s. 770)
Molekylära metoder för kartläggning av genetisk diversitet - en översikt Oscar Diaz.
Q3 Rapport 2013 Stockholm Jan Bengtsson VD, Uniflex.
Elkraft 7.5 hp distans: Kap. 3 Likströmsmotorn 3:1
UNIONEN - tillgänglighet under semestern 2014
Skånedatabasen & Region Skånes tillgänglighetsmodell
Karolinska Institutet, studentundersökning Studentundersökning på Karolinska Institutet HT 2013.
Stora additionstabellen
Punktprevalensmätning av trycksår 2011, v.40 Resultat från landstingen
V E R S I O N N R 2. 0 T A V E L I D É E R I M I L J Ö.
Bastugatan 2. Box S Stockholm. Blad 1 Läsarundersökning Maskinentreprenören 2004.
Bastugatan 2. Box S Stockholm. Blad 1 Läsarundersökning Maskinentreprenören 2007.
V ersion Dialogseminarium – Patientens väg i vården Välkommen!
Statistikbilder för november Inskrivna öppet arbetslösa och deltagare i program med aktivitetsstöd i november 2011 som andel (%) av den registerbaserade.
Statistikbilder för februari BD AC Z Y C AB S T U O N M K H I E D G X W F = 9,8 % – 1 Genomsnitt för Riket +/- 1 procentenhet = 7,7 – 9,7 % 1 =
Statistikbilder för november Källa: Arbetsförmedlingen Totalt inskrivna arbetslösa i november 2012 som andel (%) av den registerbaserade arbetskraften.
Genetik IV
Enkätresultat för Fritidshem Föräldrar 2014 Skola - Hällby skola.
INFÖR NATIONELLA PROVET
Enkätresultat för Grundskolan Elever 2014 Skola:Hällby skola.
15 x 25 meter. Skriv banenavn Skriv designet af Skriv dato MÅL sväng vänster 6 sväng höger 5 runt 7 Vänster runt hund höger runt.
Avgiftsstudie Nils Holgersson år 2007 Bild 1 Baserat på rapportversion
Finländarnas uppfattningar om äldrevården Kirsi Markkanen Utvecklingschef Tehy rf.
1 Vänsterskolan Debattartiklar. 2 Aktuell krok 3 Aktuella krokar 1. Direkt krok.
Hittarps IK Kartläggningspresentation år 3.
Bild 1 Hur använder vi KursInfo idag? Högskolan i Skövde.
Från Gotland på kvällen (tågtider enligt 2007) 18:28 19:03 19:41 19:32 20:32 20:53 21:19 18:30 20:32 19:06 19:54 19:58 20:22 19:01 21:40 20:44 23:37 20:11.
Arbetspensionssystemet i bilder Bildserie med centrala uppgifter om arbetspensionssystemet och dess funktion
TÄNK PÅ ETT HELTAL MELLAN 1-50
Grundskola Elever 2013 Grundskoleenkät - Elever ( per klass)
Statistikbilder för december Totalt inskrivna arbetslösa i december 2012 som andel (%) av den registerbaserade arbetskraften 16 – 64 år Källa: Arbetsförmedlingen.
Greppa Näringen Medlemsundersökning, kvartal 1. 1.
Helhet Händelse Agerande Kunskap om vardagsverksamheten Förståelse av vardagsverksamheten.
Kouzlo starých časů… Letadla Pár foteček pro vzpomínku na dávné doby, tak hezké snění… M.K. 1 I Norrköping får man inte.
Enkätresultat för Fritidshem Elever 2014 Skola:Fritidselever, Gillberga skola.
Grundskola Föräldrar 2013 Grundskoleenkät - Föräldrar Enhet:Gillberga skola.
1(31) Ett omdiskuterat ämne. Vad är det som händer? 2.
Levnadsvanor Levnadsvanor handlar om specifikt mänskliga beteenden i vardagliga aktiviteter som individen själv kan påverka, som exempelvis, fysisk aktivitet,
2 Agenda 1. Börja arbeta med Excel Hantera arbetsböcker 3. Formler 4. Formatera 5. Diagram 6. Skriva ut 7. Referenser mellan kalkylblad 8. Arbeta.
Täckningsgrad Dec 2014 – feb 2015 Täckningsgrad Dec 2014 – feb 2015.
Allvarlig skada för oskyddade i singelolyckor Simon Sternlund
Arbetspensionssystemet i bilder Bildserie med centrala uppgifter om arbetspensionssystemet och dess funktion
Enkätresultat för Grundskolan Föräldrar 2014 Skola - Gillberga skola.
DNA-bevis För jämförelser mellan biologiska spår (blod, hår, saliv, hudrester, andra kroppsvätskor, mm.) och prov från en misstänkt förövare av ett brott.
Regional handlingsplan ”Det goda livet för sjuka äldre” RESULTAT i VG+Skaraborg.
OpCon/xps - A case study. Club2200Page 1 OpCon/xps – A case study Club2200 Magnus Nyman & Hans Forslind.
Statistik för internationella civilekonomer
Stora subtraktionstabellen
Räkna till en miljard 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13,14,15,16,17,18,19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, En miljard är ett.
Mångfald inom en art Population och art. Vad är skillnaden?
© Anders Broberg, Ulrika Hägglund, Lena Kallin Westin, 2003 Föreläsning 12 Sökning och Sökträd.
Förskoleenkät Föräldrar 2012 Förskoleenkät – Föräldrar Enhet:Hattmakarns förskola.
Kartminne En serie bilder som ger övning av ”rutinen” Tänk på: –Vart är jag på väg? –Varifrån är kontrollen lättast att ta? –Vilken är sista säkra? –Förenkla.
Grundskola Elever 2013 Grundskoleenkät - Elever Enhet: Gillberga skola.
1 Jan Lundström OV’s Hemsida Utbildning Ledare. 2 Jan Lundström OV’s Hemsida Standard Lagrum.
När infaller Julafton och hur ofta?
Presentationens avskrift:

Elektroforetisk analys av isozymvariation Växt material Specifik infärgning Stärkelsegelelektrofores (SGE) – Polyakrylamidegelelektrofores (PAGE)

Viktiga definitioner

Diploid växt

Monomerisk enzym (Enkel polypeptidekedja) Alleles Locus-1 (gen 1) A AAABBB B En gen (= ett locus) som kodar för ett monomerisk enzyme har endast två alleles per individ homozygot heterozygot

Alleles – Loci Locus-1 Locus-2 Locus-3 ABAB ABAB Aconitase (ACO) AAABBBAB BBABAA A Aconitase

Aconitase Bandningsmönster

Alleles Locus-1 A AAABBB B En gen (= ett locus) som kodar för ett dimemerisk enzyme har endast två alleles per individ Dimeriskt enzym (två polypeptidkedjor)

Dimerisk enzym GPI – Glucose-6-phosphate isomeraseGPI – Glucose-6-phosphate isomerase Gpi-1 K K a b c BB BB BB BC BB BC BB AB AB BB BB CC BB AB BB BB BB BB

Tetramerisk enzym (tre polypeptidkedjor) Locus-1 En gen (= ett locus) som kodar för ett tetramerisk enzyme har endast två alleles per individ BBABAA Alleles A B

Tetramerisk enzym DIA - Diaphorase a b

Isozymvariation för 6 enzymsystem i arten Elymus

Fördelarna med isozymanalys Det finns ett direkt samband mellan skillnader i de genprodukter man studerar och skillnader på DNA-nivå Man studerar absoluta genetiska skillnader som är oberoende av miljön Graden av polymorfism kan variera men den är oftast hög hos korsbefruktade arter Enkel och billig

Nackdelarna med isozymanalys Man studerar ett begränsat antal loci iMan studerar ett begränsat antal loci i förhållande till DNA-baserade metoder. förhållande till DNA-baserade metoder. Allozymbandmönstren hos polyploida arter kan vara mycket svåra att tolkaAllozymbandmönstren hos polyploida arter kan vara mycket svåra att tolka

Population 1 Population 2 AB AB BB AB BB AB AA AA AA AB AA AB BB BB BB BB AB AA BB AA AA AA AA AA AB BB AB AA BB BB Statistik

Population 1 Population 2 Allele frekvens F(allele A) + F(allele B) = 1 F(A) = 2 Ho (AA) + He F(B) = 2 Ho (BB) + He 2N 2N N= Antal individer Ho = Homozygotes He = Heterozygotes Allele frekvens F(allele A) + F(allele B) = 1 F(A) = 2 Ho (AA) + He F(B) = 2 Ho (BB) + He 2N 2N N= Antal individer Ho = Homozygotes He = Heterozygotes

Population 1 Population 2 F(allele A) + F(allele B) = 1 F(allele A) + F(allele B) = 1 Pop 1 Pop 2 Pop 1 Pop 2 F(A) = 2 (4) + 6 = 14 = 0,47 F(A) = 2 (7) + 3 = 17 = 0,57 2x x15 30 F(B) = 2 (5) + 6 = 16 = 0,53 F(B) = 2 (5) + 3 = 13 = 0,43 2x15 302x15 30 F(allele A) + F(allele B) = 1 F(allele A) + F(allele B) = 1 Pop 1 Pop 2 Pop 1 Pop 2 F(A) = 2 (4) + 6 = 14 = 0,47 F(A) = 2 (7) + 3 = 17 = 0,57 2x x15 30 F(B) = 2 (5) + 6 = 16 = 0,53 F(B) = 2 (5) + 3 = 13 = 0,43 2x15 302x15 30

Statistisk bearbetning av resultaten BIOSYS-1 GENOTYPE FREQUENCY INPUT NOTU=2,NLOC=8,NALL=3 8(1X,A5)) ACO-1 ACO-2 ACO-3 ACO-4 MDH-2 PGD-1 PGD-2 PGM-1 STEP DATA: DATYP=2,NCOL=6,ALPHA; (6X,6(1X,2A1,1X,I2) Population 1 ACO-1 AA:50 ACO-2 BB:20 BC:30 ACO-3 AB:22 BB:28 ACO-4 BB:50 MDH-2 BB:49 BC:01 PGD-1 AA:50 PGD-2 AA:40 AB:10 PGM-1 BB:50 Population 2 ACO-1 AB:50 ACO-2 AB:20 BC:30 ACO-3 AB:22 BC:28 ACO-4 BB:50 MDH-2 BB:49 BC:01 PGD-1 AA:50 PGD-2 AA:40 AB:10 PGM-1 BB:50 BIOSYS-1 (Swofford & Selander 1989) (A computer program for the analysis of allelic variation in population genetics) Den absoluta mängden av genetisk variation - P = Frekvensen loci med genetisk variation - H = Heterozygoti Fördelningen av den totala genetiska variationen mellan och inom populationen Fördelningen av den totala genetiska variationen mellan och inom populationen Graden av genetisk likhet mellan populationer Graden av genetisk likhet mellan populationer - D = “Genetic distance”