Presentation laddar. Vänta.

Presentation laddar. Vänta.

Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson Forsknings- och utvecklingschef mikrobiologi Lantmännen Analycen.

Liknande presentationer


En presentation över ämnet: "Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson Forsknings- och utvecklingschef mikrobiologi Lantmännen Analycen."— Presentationens avskrift:

1 Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson Forsknings- och utvecklingschef mikrobiologi Lantmännen Analycen AB

2

3 Varumärken

4 Analycens lab  Laboratorier –Finland: Tampere –Norge: Moss –Danmark: Frederica –Polen: Warszawa –Sverige: Lidköping, Kristianstad, Örebro, Skara, Uppsala

5 DNA analys -ny teknik  In vitro DNA amplifiering (PCR) 1983

6 Brett användningsområde (Analycen idag)  Patogena mikroorganismer (näringsmedel, vatten, växter)  Allergena födoämnen  Djurslagsbestämning  GMO

7 Patogena mikroorganismer  Salmonella  Shigella  Campylobacter  EHEC  Växtpatogena svampar  m.fl.

8 DNA  Arvsmassa DNA/RNA  DNA baser (nukleotider)  DNA bibliotek

9 Två syften  A) Detektion av mikroorganismer, arter, gener  B) Individidentifiering, smittspårning

10 PCR  Uppförökning av DNA  Avgränsas av s.k. primers (måste vara specifika)  Probe som kontroll av specificitet och för detektion

11 PCR -fördelar  Relevanta egenskaper mäts  Svårodlade mikroorganismer detekteras  Snabbheten  Specificiteten  Objektiv

12 PCR – att tänka på  Inte alltid kompatibel med traditionell analys  Döda/levande bakterier  Hög detektionsnivå > 1000 bakterier/ml  Provupparbetning

13 Lagstiftning/standardisering  DNA ok för livsmedelskontroll (gäller validerade metoder enl ISO 16140)  Standarder för EHEC och virus på gång (Norovirus och Heptit A)  Samarbete livsmedel-vatten standardisering  EHEC, Salmonella aktuellt för vatten  EU ref lab för parasiter (Cryptosporidium, Giardia)

14 En utskrift från Dagens Nyheters nätupplaga, DN.se.  Publicerad 15 aug :53 Smitta på förskola i Sundbyberg Sundbyberg. Ett barn har smittats och ytterligare 12 barn och en ur personalen har visat tecken på att ha smittats av en infektion på en förskola i Sundbyberg. cryptosporidiuminfektion - Vi har konstaterat att ett barn har fått en cryptosporidiuminfektion, som är en parasit, säger Ingegerd Hökeberg, biträdande smittskyddsläkare vid smittskyddsenheten i Stockholms läns landsting

15 Erfarenheter av Legionella analyser

16 Protocol 5 h to result Filtration of 1L water Lysis of Bacteria, extraction and DNA purification Real-time PCR detection and/ or quantification Legionella sppL. pneumophila Screening : specific sequences detection / controls Quantification : specific sequences detection / Standards

17 Erfarenheter PCR och Legionella  PCR bra för detektion  Korrelation med PCR –odling dålig  Gränser baseras på odling

18

19 Framtid  Fortsatt utveckling av DNA tekniken  Odling och isolering fortsatt viktigt  DNA standarder för vattenburna patogener

20 TACK!


Ladda ner ppt "Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson Forsknings- och utvecklingschef mikrobiologi Lantmännen Analycen."

Liknande presentationer


Google-annonser