Virusstrukturer, kap 16
Ikosaeder Dodekaeder
Uppbyggnad av virusstruktur
Tretalig symmetri Asymmetrisk enhet Den minsta enhet som genom translation och rotation repeteras 3 asymm.enheter/cell = Totalt 60 asymm. Enheter, dvs 60 protein subenheter krävs för att bilda en viruspartikel med ikosaeder symmetri
Satellite tobaco necrosis virus
Triangulation numbers Endast multipler av 60 subenheter kan finnas för att bibehålla ikosaedrisk symmetri T=1,3,4,7,......pseudo-ekvivalent packning
T=3 , dvs totalt 180 subenheter
T=4 , dvs totalt 240 subenheter
Tomato bush stunt virus , T=3 Tre domäner
Tomato bush stunt virus , T=3
Tomato bush stunt virus , T=3
Jelly roll motiv Satellite tobaco necrosis virus coat protein VP1 poliovirus
Jelly roll motiv Schematisk jelly roll VP2 human Rhinovirus
Jelly roll polio virus B-sträng 1(röd) B-sträng 8 (blå)
Picorna virus Molekylvikt ca 8.5 miljoner dalton Enkelsträngar RNA ca 8000 baser
Uppbyggnad av Picornavirus VP4 på insidan
Uppbyggnad rhinovirus, ”förkylningsvirus”
Jelly roll
Rhinovirus med Pleconaril (antiviralt läkemedel) Jelly-roll
MS 2 bakteriofag
Sindbis virus, core protein
Sindbis virus, core protein Katalytiska triaden, Asp-His-Ser C-terminal i aktiva ytan inaktiv form
Jämförelse kymotrypsin
Polyomavirus
SV40
Schematisk bild av SV40 subenhet
Några exempel från PDB Bakteriofag phiX174 SV40 Poliovirus Rhinovirus med Pleconaril