Bioinformatisk analys av Arthropod Receptorer Lukas, Markus & Erik CGB 1 December 2005
GR05A
OR46A
Topologi-Homologi?
Robertsons alignment
Hypotes 1 ➲ Både OR och GR har o7i-topologi +De är släkt enl. Scott et al., Homologi Samma topologi +Stämmer överens med “prior belief” -Strider mot N-terminala mätpunkter i OR +Skulle kunna vara en effekt av olyckligt valt glyko- syleringssite. -Få prediktorer tror på hypotesen
Hypotes 2 ➲ OR har o5i-topologi och GR har o7i-topologi +Mest troligt givet mätpunkter och prediktioner -Strider mot vad “alla” förväntar sig -Icke konserverad topologi mellan homologer +Släktskap kan ifrågasättas t.o.m. inom GR -Få prediktorer tror på hypotesen