Membranproteiner Kapitel 12

Membranproteiner Perifera membranproteiner Integrala membranproteiner

Colicin A Paradox: Membranprotein Som är lösligt både i vatten och instopppat i membran Alternativ Konformation i lösning jämfört med i membran

Bakterierhodopsin

Bakterierhodopsin

Retinal, ljusabsorberande pigment

Röd=exciterat tillstånd Rhodopsin Retinal Blå= grundtillstånd Röd=exciterat tillstånd

Proton förflyttning hos rhodopsin

Proton förflyttning hos rhodopsin

Proton förflyttning hos rhodopsin

Porin

Trimer av porin

K+-kanalen

K+-kanalen

K+-kanalen

K+-kanalen

K+-kanalen ”från sidan” ”uppifrån”

Fotosyntetiska pigment Ubikinon Klorofyll

Diffraktionsfoto på fotosyntetiska reaktionscentrat

Fotosyntetiska reaktionscentrat

Fotosyntetiska pigment

Schematisk bild över reaktionscentrat

Light harvesting complex, LH2

Light harvesting complex, LH2

Light harvesting complex, LH2

Light harvesting complex, LH1

LH1, LH2 och reaktionscentrat

Energiflöde via LH2 och LH1 till reaktionscentrat

Hydropathy plot Beräkna utgående från ett ”fönster” (19 aa) hydrofobiciteten och plottar mot sekvensen Kan förutsäga vilka delar av en transmembranhelix som är inbäddad i membranet Kan även användas för cytosoliska proteiner, vilken information får man då?

Hydropathy plot

Hur beräknas dessa skalor?

Några exempel från PDB K+-kanalen Rhodopsin Colicin A

Signaltransduktion kap 13

Topologi cH-rasp21 Topologisk brytpunkt

Bindning av GTP till aktiva ytan

Inbindning av GTP till transducin

Komformationsändringar hos transducin

Transducin

Komformationsändringar hos transducin

G protein, Transducin, heterotrimer

G protein, Transducin, heterotrimer

G protein, Transducin, b-subenheten

Phosducin, regulator av GTPase aktivitet

Phosducin bindning till transducin dimer Phosducin, blockerar bindning Till a-subenheten

Human growth hormone Four-helix bundle

Human growth hormone receptor Bindningsyta för HGH Immunoglobulinfold

Bindning av HGH till HGH receptor 1:2 komplex Osymmetrisk bindning av HGH

Bindning av Prolactin receptor till HGH 1:1 komplex

Hormon receptor interaktion

Hormon receptor interaktion

Tyrosinkinas familjen

Src Tyrosinkinas Signalprotein som kontrollerar celltillväxt Signalering sker med hjälp av fosforylering av tyrosiner Hundratals olika Tyrosinkinaser som är närbesläktade, ”Knock-out” ofta ingen effekt Onkogen, genen alltid aktiv ger ohämmad celltillväxt, utveckling av cancer

Src Tyrosinkinas, SH2 domänen

Src Tyrosinkinas, aktiv och inaktiv form Från: PDB, ”molecule of the month”

From: Time Magazine 28 May 2001

Tyrosinkinas med inbunden Gleevec (Cancermedicin)

Några exempel från PDB Transducin G protein trimer Inbinding av GTP/GDP kolla konformationsändring