Ladda ner presentationen
Presentation laddar. Vänta.
1
Membranproteiner Kapitel 12
2
Membranproteiner Perifera membranproteiner Integrala membranproteiner
5
Colicin A Paradox: Membranprotein Som är lösligt både i vatten och instopppat i membran Alternativ Konformation i lösning jämfört med i membran
6
Bakterierhodopsin
7
Bakterierhodopsin
8
Retinal, ljusabsorberande pigment
9
Röd=exciterat tillstånd
Rhodopsin Retinal Blå= grundtillstånd Röd=exciterat tillstånd
10
Proton förflyttning hos rhodopsin
11
Proton förflyttning hos rhodopsin
12
Proton förflyttning hos rhodopsin
13
Porin
14
Trimer av porin
15
K+-kanalen
16
K+-kanalen
17
K+-kanalen
18
K+-kanalen
19
K+-kanalen ”från sidan” ”uppifrån”
20
Fotosyntetiska pigment
Ubikinon Klorofyll
21
Diffraktionsfoto på fotosyntetiska reaktionscentrat
22
Fotosyntetiska reaktionscentrat
23
Fotosyntetiska pigment
24
Schematisk bild över reaktionscentrat
25
Light harvesting complex, LH2
26
Light harvesting complex, LH2
27
Light harvesting complex, LH2
28
Light harvesting complex, LH1
29
LH1, LH2 och reaktionscentrat
30
Energiflöde via LH2 och LH1 till reaktionscentrat
31
Hydropathy plot Beräkna utgående från ett ”fönster” (19 aa) hydrofobiciteten och plottar mot sekvensen Kan förutsäga vilka delar av en transmembranhelix som är inbäddad i membranet Kan även användas för cytosoliska proteiner, vilken information får man då?
32
Hydropathy plot
33
Hur beräknas dessa skalor?
35
Några exempel från PDB K+-kanalen Rhodopsin Colicin A
36
Signaltransduktion kap 13
40
Topologi cH-rasp21 Topologisk brytpunkt
41
Bindning av GTP till aktiva ytan
42
Inbindning av GTP till transducin
43
Komformationsändringar hos transducin
44
Transducin
45
Komformationsändringar hos transducin
51
G protein, Transducin, heterotrimer
52
G protein, Transducin, heterotrimer
53
G protein, Transducin, b-subenheten
57
Phosducin, regulator av GTPase aktivitet
58
Phosducin bindning till transducin dimer
Phosducin, blockerar bindning Till a-subenheten
59
Human growth hormone Four-helix bundle
60
Human growth hormone receptor
Bindningsyta för HGH Immunoglobulinfold
61
Bindning av HGH till HGH receptor 1:2 komplex
Osymmetrisk bindning av HGH
62
Bindning av Prolactin receptor till HGH 1:1 komplex
63
Hormon receptor interaktion
64
Hormon receptor interaktion
65
Tyrosinkinas familjen
66
Src Tyrosinkinas Signalprotein som kontrollerar celltillväxt
Signalering sker med hjälp av fosforylering av tyrosiner Hundratals olika Tyrosinkinaser som är närbesläktade, ”Knock-out” ofta ingen effekt Onkogen, genen alltid aktiv ger ohämmad celltillväxt, utveckling av cancer
68
Src Tyrosinkinas, SH2 domänen
69
Src Tyrosinkinas, aktiv och inaktiv form
Från: PDB, ”molecule of the month”
70
From: Time Magazine 28 May 2001
71
Tyrosinkinas med inbunden Gleevec (Cancermedicin)
72
Några exempel från PDB Transducin G protein trimer
Inbinding av GTP/GDP kolla konformationsändring
Liknande presentationer
