Grundläggande Biostatistik

Slides:



Advertisements
Liknande presentationer
Punkt- och intervallskattning Felmarginal
Advertisements

Bedömning av uppfyllelse av miljökvalitetsnormer
Inferens om en population Sid
Hej hypotestest!. Bakgrund  Signifikansanalys  Signifikansprövning  Signifikanstest  Hypotesprövning  Hypotestest Kärt barn har många namn Inblandade:
Vetenskaplig utveckling Läkarprogrammet KI HT 2010 termin 4
Den vetenskapliga artikeln
Skånes Universitetssjukhus
F11 Olika urvalsmetoder, speciellt obundet slumpmässigt urval (OSU)
Behandling Tillfrisknande ? Tid EXPONERINGUTFALL.
Vetenskaplig utveckling Läkarprogrammet KI HT 2010 termin 4
Workshop i statistik för medicinska bibliotekarier!
Vad ingår kursen? i korta drag
Tillämpad statistik Naprapathögskolan
Sammanfatta siffrorna…
Skattningens medelfel
Experimentell utvärdering Språkteknologisk forskning och utveckling (HT 2006)
Förelasning 1 Kursintroduktion Statistiska undersökningar
Förelasning 6 Hypotesprövning
Föreläsning 81 Sampling och urval Ofta möter vi påståenden av typen “4.5 miljoner svenskar såg VM-finalen i fotboll”, “en svensk tolvåring väger i genomsnitt.
FL7 732G70 Statistik A Detta är en generell mall för att göra PowerPoint presentationer enligt LiUs grafiska profil. Du skriver in din rubrik,
Egenskaper för punktskattning
Föreläsning 7 Fysikexperiment 5p Poissonfördelningen Poissonfördelningen är en sannolikhetsfördelning för diskreta variabler som är mycket.
Linjär regression föreläsning 9
Normalfördelningen och centrala gränsvärdessatsen
F8 Hypotesprövning. Begrepp
F8 Hypotesprövning. Begrepp
Grundläggande statistik ht 09, AN
Forskningsmetodik Sampling och urval Hypotesprövning Lektion 9
Statistik Lars Valter Fil.lic. Statistik
Matematisk statistik och signal-behandling - ESS011 Föreläsning 1 Igor Rychlik 2015 (baserat på föreläsningar av Jesper Rydén)
732G22 Grunder i statistisk metodik
Läkarprogrammet – Termin 5, VT 2015
Statistiska samband i trafikolyckor Av: Lina Forsberg Hangjin Lee Daniel Leo Carl-Mikael Westman.
Lite repetition och SAMBAND & INFERENS. population Population Stickprov, urval INFERENS = Dra slutsatser från data om hela populationen utifrån ett stickprov.
Medicinsk statistik Läkarprogrammet HT Medicinsk statistik Varför behöver Ni kunskap i medicinsk statistik? Självständigt arbete Kunna tolka resultat.
Kostvetenskapliga Metoder 1. VAD ÄR STATISTIK? 2. DESKRIPTION 3. NORMALFÖRDELNING 4. HYPOTESPRÖVNING a) t-test b) ickeparametriska test c) chitvåtest.
Grundläggande epidemiologi Susanna Calling, läk, med dr
SAMBAND. Vi vill undersöka om det finns ett samband mellan tentamensresultat och genomsnittligt antal timmar/dag man studerat. Person ABCDEFGHIJ Timmar/
Lite repetition och SAMBAND & INFERENS. population Population Stickprov, urval INFERENS = Dra slutsatser från data om hela populationen utifrån ett stickprov.
Medicinsk statistik II Läkarprogrammet T5 HT 2013 Susann Ullén FoU-centrum Skåne Skånes Universitetssjukhus.
Deskription + enkät Mätnivån styr hur man kan analysera data Tabeller – frekvenstabeller Diagram – cirkeldiagram, stapeldiagram, histogram, boxplot Beskrivande.
Vetenskaplig metod Statistik 1. VAD ÄR STATISTIK? 2. DESKRIPTION 3. URVAL 4. STATISTISK INFERENS OCH HYPOTESPRÖVNING a) t-test b) ickeparametriska test.
Statistisk hypotesprövning. Test av hypoteser Ofta när man gör undersökningar så vill man ha svar på olika frågor (s.k. hypoteser). T.ex. Stämmer en spelares.
Vad är Statistik? Inom statistik teorin studeras -Hur vi samlar in data. -Hur data analyseras och vilka slutsatser som kan dras från data. -Hur insamlad.
Föreläsning 1-3 Introduktion till kursen Beskrivande statistik.
Deskription + enkät Mätnivån styr hur man kan analysera data Tabeller – frekvenstabeller Diagram – cirkeldiagram, stapeldiagram, histogram, boxplot Beskrivande.
UTVÄRDERING OCH KVALITET Metod för utvärderingen viktig för utvärderingens status. En utvärdering utifrån ett vetenskapligt arbetssätt ger andra möjlighet.
Statistisk inferensteori. Inledning Den statistiska inferensteorin handlar i huvudsak om att dra slutsatser från ett slumpmässigt urval (sannolikhetsurval)
En sak i taget 1. Mata in data 2. Förbered data för beräkningar 3. Beräkna 1. Börja med att testa din hypotes 2. Därefter titta på ev bakomliggande faktorer.
Kvantitativa forskningsmetoder Sociologi A VT 2015 Ilkka Henrik Mäkinen (momentansvarig)
Samband & Inferens Konfidensintervall Statistisk hypotesprövning –Hypotetisk –deduktiv metod Samband mellan nominal/ordinal-variabler –Chi2-test Samband.
1 Numeriska Deskriptiva Tekniker. 2 Centralmått §Vanligtvis fokuserar vi vår uppmärksamhet på två typer av mått när vi beskriver en population: l Centraläge.
Hypotesprövning. Statistisk hypotesprövning och hypotetisk-deduktiv metod Hypotetisk-deduktiv metod: –Hypotes: Alla svanar är vita. –Empirisk konsekvens:
Idag: Repetition av Chi2-test Kap 6*, Kodning av svaren Kap 10*, Olika feltyper Kap 12*, Rapportskrivning *Dahmström.
Samband & Inferens Konfidensintervall Statistisk hypotesprövning –Hypotetisk –deduktiv metod Samband mellan nominal/ordinal-variabler –Chi2-test Samband.
Samband & Inferens Konfidensintervall Statistisk hypotesprövning
INFERENS & SAMBAND. population Population Stickprov, urval INFERENS = Dra slutsatser om hela populationen utifrån ett stickprov Data, observationer.
1 UNDERSÖKNINGSMETODIK Ett gemensamt syfte för alla undersökningar är att få ökad kunskap om ett visst problemområde Statistiska undersökningar kan vara.
INFERENS & SAMBAND. population Population Stickprov, urval INFERENS = Dra slutsatser från data om hela populationen utifrån ett stickprov Data, observationer.
Samband & Inferens Hypotetisk –deduktiv metod Samband mellan nominal/ordinal-variabler –Chi2-test Samband mellan kvot-varibaler –Korrelationskoefficient.
Introduktion. 2 Vad är statistik? ”En massa siffror” Beskrivning av staten Metodlära.
Enkel Linjär Regression. 1 Introduktion Vi undersöker relationer mellan variabler via en matematisk ekvation. Motivet för att använda denna teknik är:
INFERENS OCH SAMBAND. Vi vill undersöka om det finns ett samband mellan tentamensresultat och genomsnittligt antal timmar/dag man studerat. Person ABCDEFGHIJ.
STATISTISK METODIK 1. INLEDNING / VAD ÄR STATISTIK? 2. UNDERSÖKNINGSMETODIK 3. DESKRIPTION 4. SAMBAND.
Sju sätt att visa data Sju vanliga och praktiskt användbara presentationsformat vid förbättrings- och kvalitetsarbete.
Marknadsundersökning Kap 12
Data och att presentera data
Förelasning 1 Kursintroduktion Statistiska undersökningar
Grundl. statistik F2, ht09, AN
Grundläggande begrepp
Presentationens avskrift:

Grundläggande Biostatistik Joacim Rocklöv, Lektor Epidemiologi och global hälsa Umeå Universitet

Formell analys Informell data analys Design och mätning Modellbaserad analys Regression Logistisk regression Överlevnadsanalys Konfidensintervall P-värden (enkla tester) Formell analys Hitta misstag Hantera extremvärden Bortfall Informell data analys Lär känna data, tabeller, mått, grafer Hur samlas data in? Mätskalor reliabilitet validitet Design och mätning

Syften.. Skatta prevalens och risker för insjuknande av sjukdom Jämföra utfall av behandling tex läkemedel/rehabiliteringsmetoder Kartlägga riskfaktorer, dvs faktorer som ökar risken för sjukdom Följa förlopp – tillväxtkurvor, etc…

Strategi vid kliniska prövningar - Sample size beräkningar Datainsamling Beskrivande statistik Statistisk analys Inferens - Presentation/publikation

Mätning Variabel Kategorisk Kvantitativ Diskret Kontinuerlig Ordnad Ej ordnad

Grupper av variabler Utfallsvariabler – primära/sekundära Behandlingsvariabler/riskfaktorer – variabler som påverkar utfallet Bakgrundsvariabler – demografiska variabler Förväxlingsvariabler – confounders/inflytelserika men ej intressanta variabler för frågeställningen

Datanivåer (typer av variabler) Kvalitativa variabler = kategorivariabler Kvantitativa variabler = numeriska variabler Nominala variabler Utfallen är kategorier som inte kan rangordnas Ordinala variabler Utfallen är ordnade kategorier Intervall- variabler Kan beräkna differenser men inte kvoter Kvot- variabler Kan beräkna differenser och kvoter Blodtyp Kön Yrke Rökning (ja/nej) VAS-skalan Betyg Självskattad hälsa, smärta Rökning (nej, lite, mycket) Temperatur Mätt i C° F° K° Längd Vikt, ålder Rökning (antal cigaretter per dag)  

Variabel Kategorier Typ av variabel Datanivå ID Kön Blodgrupp VIKT Man/Kvinna Kat Nominal Binär Blodgrupp O, A, B, AB VIKT Mätt i kg Kvant Kontinuerlig Rökare Nej, Ja Smärta Obetydlig, Måttlig, Svår, Outhärdlig Ordinal Vårddagar Antal vårdagar Diskret

Orsak verkan samband? x y x påverkar y x y x är associerad med y

Studiedesign Experiment Observationsstudie Tvärsnitts- undersökning Longitudinell undersökning Klinisk prövning Kohortstudie Fall-kontroll studie

Randomiserad kontrollerad studie Behandling Utfall Patienter Randomisering Kontroll/ Placebo Utfall Fler armar kan förekomma

Kohort studie Exponerade Utfall Population Ej exponerade Utfall

Fall kontroll studie Fall Exponerade Kontroller Ej exponerade

Tvärsnitts-studie Mätningar Population Urval

Analys och inferens Skattning av sant medelvärde Sant medelvärde Urvalsmetod Population Urval

Inferens 2: Hypotesprövning Skiljer sig män och kvinnor åt vad avser kroppstemperatur? Report temp_c sex Mean N Std. Deviation Man 36,7248 65 ,38820 Kvinna 36,8855 ,41305 Total 36,8051 130 ,40732 P-värde = 0.024 Slutsats: ?

Statistisk inferens de metoder som används för att utifrån ett stickprov dra slutsatser om en hel population.

Hypotesprövning Vid prövning av behandlingsmetod på två grupper: H0: ingen skillnad mellan grupper HA: skillnad mellan grupper När väljer vi nollhypotesen och när förkastar vi den till fördel för den alternativa hypotesen?

Konfidensintervall Skattningar är osäkra på grund av att vi studerar en del av populationen. Skattningar kan ges med FELMARGINAL. Det kallas KONFIDENSINTERVALL. Konfidensintervallet anges med grad av osäkerhet som kallas konfidensnivå (95%, 99%, etc)

Konfidensintervall intervall som inkluderar det sanna medelvärdet nästan säkert (95%). Kroppstemperatur Konfidensintervallet blir 36.73 – 36.88 Detta intervall inkluderar populationens medelvärde nästan säkert (med 95% konfidens)

P-värde p-värde = sannolikheten för det erhållna utfallet eller extremare under förutsättning att nollhypotesen är sann. Om denna sannolikhet är liten tror vi att nollhypotesen är falsk. Vi förkastar nollhypotesen. Om denna sannolikhet är stor kan vi inte förkasta nollhypotesen.

Praxis för bedömning av p-värden p > 0.05 ingen skillnad (ej signifikant) 0.05>p>0.01 skillnad (signifikant *) 0.01>p>0.001 skillnad (signifikant **) 0.001>p skillnad (signifikant ***)

Typ I och II fel H0: grupp1=grupp2 HA: grupp1≠grupp2 Null Hypothesis is true (H0) Alternative Hypothesis is true (HA) Reject Null Hypothesis Negative Right decision Type 2 error (β) Positive Type 1 error (α) Type 1 error is referred to as false positive Type 2 error is referred to as false negative

Begreppet power – studiens styrka Sannolikheten att kunna påvisa en skillnad mellan grupper (tex behandlingsgrupper) om den finns där Utgör en komponent vid bestämning av studiens storlek Andra komponenter är: Den minsta skillnad vi vill kunna påvisa Risk för ett falskt positivt fynd (alfa-fel) Storleken av spridningen i utfallet Val av metod

Presentation av data Bild Mått Tabell Val styrs av variabeltyp

Lägesmått Medelvärde Median ”Mittersta värdet” 36.8 gr C 36.8 gr C

Variationsmått Standardavvikelse Kvartilavstånd s = 4.13 år (IQR) Variationsvidd (Range) s = 4.13 år q1 = 36.56, q3 = 37.06 IQR= 0.5 grC max =38.22, min = 35.72 VV = 2.5

Grafisk beskrivning: Histogram Referens

Grafisk bild av samband (scatter plot) År styrka i höger och vänster hand associerade?

Grafisk beskrivning: Boxplot

Tabellpresentation

Jämförelse mellan grupper